遺伝子組み換え作物に対する安全性の確認は、生物多様性影響（環境に対する安全性）の評価と食品及び飼料としての安全性の評価に大別されます。そして、これらの安全性評価は、個々の遺伝子組み換え作物ごとに行われています。 日本での遺伝子組み換え作物の審査は、生物多様性影響は農林水産省と環境省が行い、飼料としての安全性は農林水産省、食品としての安全性は厚生労働省が行います。 また、こうした安全評価は経済協力開発機構（OECD）および世界保健機構（WHO）、国連食糧農業機関（FAO）による国際基準に沿って、組み換えられる前の作物との比較等によって行われています。

生物多様性影響についての評価

生物多様性（環境）に対する影響については、「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律（カルタヘナ法）」に基づいて安全性が確認されます。遺伝子組み換え農作物については、農林水産省と環境省が承認を行います。 開発者は、利用する作物や遺伝子の性質を明らかにした上で、生育特性や生殖特性、交雑性などに関するデータを収集して、環境に対する影響を調べます。その結果が農林水産省に提出され、専門家による審査が行われます。
遺伝子組み換え農作物の生物多様性影響評価の流れ
遺伝子組み換え農作物の生物多様性影響についての評価
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